|
Solexa 高通量测序技术服务
特色
Ø 通量高、效率高、方向多元、精确性高、成本低
Ø 无需预先知道模式物种基因组序列,无须合成探针,可直接进行全基因组表达研究
Ø 不需要实验假设的支持
Ø 可以检测到单拷贝分子的变化
Ø 没有传统方法的荧光背景噪音的干扰
原理
Solexa测序技术原理为专利的“可逆性末端终结反应”,提高碱基合成来进行测序。四种碱基分别标记四种不同荧光,每个碱基末端被保护基团封闭,单次反应只能加入一个碱基,经过扫描,读取该次反应颜色后,该保护基团被除去,下一个反应可继续进行,如此反复,得出碱基的精确序列。
服务流程
Ø 将目的DNA从细胞中取出,将其打断成100-200bp大小的片段,再将片段与接头相连接,然后经过PCR大量扩增成DNA簇。
Ø 将带有接头的DNA与芯片进行绑定。
Ø 将已经用荧光标记染料标记好的核苷和聚合酶加入到单分子阵列中,互补的核苷与核苷酸片段的第一个碱基配对,在酶的作用下,与引物结合。
Ø 再经过碱基互补配对,使单链延伸,通过生物发光蛋白进一步检测信号。
提供服务
Ø 测序与重测序
Ø 在DNA水平上:可以对基因组甲基化进行分析; SNP分型研究;大规模筛查基因突变;对基因多态性进行进一步的判定与探究。
Ø 在RNA水平上:可以对小RNA片段进行扫描、定量与鉴定;对全基因组进行广谱表达研究。
Ø 在蛋白质水平上:研究蛋白质和核酸的相互作用;对蛋白质和核酸进行定位研究。
Ø 染色质免疫共沉淀测序(ChIP-Seq):为了获得全基因组范围内DNA甲基化、组蛋白各种修饰、转录因子等的高分辨率分布图,我们可以利用Illumina Genome Analyzer新一代测序技术,对染色质免疫共沉淀(Chip)获得的DNA片断进行大规模测序,并把所关注的蛋白的DNA结合位点精确定位到基因组上。
Ø 数据分析 |