大片断DNA测序

     诺赛拥有ABI3730xl测序平台和齐全的配套设施，其鸟枪法测序（Shotgun Sequencing），采用直接将整个基因组打成2KB左右的DNA片段，把这些DNA片断装入适当的载体，构建Shotgun文库，从中随机挑选克隆片断进行测序，最后运用生物信息学方法将测序片段拼接成全基因组序列。我们具有成熟的文库构建平台，专业的实验人员，严格的库检流程。

特色

  Ø     服务内容：文库构建；大规模测序；生物信息分析

       Ø     应用范围：任何物种基因组、fosmid、cosmid、BAC、病毒、线粒体、叶绿体等  

服务流程

  Ø      用物理方法对纯化的大片断DNA进行切断处理，随后建立高度随机、插入片段大小为2kb左右的基因组文库。

  Ø     高效、大规模的末端测序。

  Ø       应用生物信息学软件将相互重叠的读出序列组装成连续的最小重叠群。

  Ø       填补缺口。采用传统的Primer walking、PCR测序和新一代454或solex测序技术相结合的方式来完成补洞。

  Ø        基因注释。提供基因组分析和已知功能基因注释等生物信息学分析。

客户提供

  Ø      对植物、动物、微生物组织，请提供足量的新鲜样品（4℃保存，不超过一天）或将新鲜样品立即存于液氮或-80℃，在一周内寄样

  Ø         若用植物样品建基因组文库，为了减少文库中的叶绿体污染，样品须是植物的黄化苗嫩芽

质量

  Ø         精细图，基因组覆盖度大于95%，基因区覆盖达到98%以上，单碱基错误率低于十万分之一

  Ø         完成图，填补gaps，序列覆盖率和准确率在99.99%以上