STRs分析
短串联重复序列(short tandem repeat, STR)是基因组染色体上一种可遗传的、体细胞稳定性的、且具有高度多态性的短核苷酸重复序列,具有种类多,分布广等特点。这种多态性标志已广泛用于遗传多样性分析、连锁图谱制作、疾病连锁分析和家系标识等研究。
作为主要的STRs分析手段,GeneScan是一种用途广泛的DNA片断分析技术,与传统方法相比,GeneScan具有快捷、精确度高和通量大的优点。诺赛基因通过ABI3700型测序仪为国内外客户提供高品质的基于GeneScan技术的STRs分析相关服务。
全基因组扫描
我们使用ABI全基因组扫描试剂盒提供全基因组扫描服务,该项技术选用ABI-Perlin-Elmer公司提供的382个微卫星标记,覆盖了人类基因组(22条常染色体,2条性染色体)的所有区域。
特定区域位点的扫描
特点:
针对某一染色体的可疑区域,选取部分微卫星位点进行扫描服务,具体项目包括实验方案设计、根据方案进行PCR、ABI 3700型测序仪数据采集、利用专业软件进行数据分析和最终的连锁分析等。
Ø 技术平台:ABI3100和3730,基因型分析软件,荧光标记OLIGO的化学合成
Ø 若您研究的位点较多,为了节约您的成本,我们一个泳道可以同时检测三种不同的荧光
实验流程:
Ø 客户收集标本,提取DNA
Ø 确定STR位点,设计试验方案,包括荧光标记的选择、引物的设计、合成和标记,荧光分子量内标的选用等
Ø PCR,并琼脂糖电泳检测,若PCR产物特异性不够,将进行优化
Ø PCR产物通过测序仪电泳检测,获得扩增片断大小的数据
Ø 数据处理

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