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 STRs分析


       短串联重复序列(short tandem repeat, STR)是基因组染色体上一种可遗传的、体细胞稳定性的、且具有高度多态性的短核苷酸重复序列,具有种类多,分布广等特点。这种多态性标志已广泛用于遗传多样性分析、连锁图谱制作、疾病连锁分析和家系标识等研究。

     作为主要的STRs分析手段,GeneScan是一种用途广泛的DNA片断分析技术,与传统方法相比,GeneScan具有快捷、精确度高和通量大的优点。诺赛基因通过ABI3700型测序仪为国内外客户提供高品质的基于GeneScan技术的STRs分析相关服务。

全基因组扫描 
     我们使用ABI全基因组扫描试剂盒提供全基因组扫描服务,该项技术选用ABI-Perlin-Elmer公司提供的382个微卫星标记,覆盖了人类基因组(22条常染色体,2条性染色体)的所有区域。

特定区域位点的扫描 
 

特点:

     针对某一染色体的可疑区域,选取部分微卫星位点进行扫描服务,具体项目包括实验方案设计、根据方案进行PCR、ABI 3700型测序仪数据采集、利用专业软件进行数据分析和最终的连锁分析等。

Ø    技术平台:ABI3100和3730,基因型分析软件,荧光标记OLIGO的化学合成

Ø    若您研究的位点较多,为了节约您的成本,我们一个泳道可以同时检测三种不同的荧光

实验流程:

Ø    客户收集标本,提取DNA

Ø    确定STR位点,设计试验方案,包括荧光标记的选择、引物的设计、合成和标记,荧光分子量内标的选用等

Ø    PCR,并琼脂糖电泳检测,若PCR产物特异性不够,将进行优化

Ø    PCR产物通过测序仪电泳检测,获得扩增片断大小的数据

Ø    数据处理

 
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