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        • 产品名称: >SNP筛查与鉴定
        • 上架时间: 2014-10-08
        • 浏览次数: 1027

               

                平台介绍

                单核苷酸多态性(Single Nucleotide PolymorphismsSNPs),即指由于单个核苷酸碱基的改变而导致的核酸序列的多态性。在不同个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列中,绝大多数核苷酸序列一致而只有一个碱基不同的现象,这就是SNP

          SNPs所表现的多态性只涉及到单个碱基的变异。一般来说,一个SNPs位点只有两种等位的基因,因此又叫双等位基因。单核苷酸多态性包括单个碱基的缺失和插入,更多情况是单个碱基的置换。通常情况下是一种二等位基因的变异,多为转换,即一种嘧啶碱基换为另一种嘧啶碱基,或一种嘌呤碱基换为另一种嘌呤碱基,转换与颠换之比为21SNPCG序列上出现最为频繁,而且多是CT,因为CGC即胞嘧啶常为甲基化的,自发脱氨后即变为胸腺嘧啶。SNP的分布不均匀,非转录序列中要多于转录序列,绝大多数位于蛋白的非编码区。
          SNP筛查与鉴定已经成为基因功能研究、寻找疾病基因和基因型鉴定等的主要研究手段。诺赛基因可利用多套技术方案提供量身定做的个性化服务,包括PCR直接测序法、Taqman法、MassArray法等。

         

               平台优势

               诺赛基因是中国最早提供SNP研发服务解决方案的公司之一,有十四年的服务经验积累:

          1、丰富的大规模SNP鉴定及比较项目的运作经验;
          2、标准化的项目质控流程;
          3、适应不同研发阶段性价比需要的技术路线。

         

               平台比较

         

        方法

        优点

        缺点

        应用范围

        PCR测序

        准确性高

        价格高

        临床小样本量,少位点的检测

        TaqMan探针法

        准确性高

        价格高

        大样本,少位点

        KASP

        准确性高

        价格低

        样本量和检测位点不受限制

        芯片法

        准确性低

        价格高

        超多位点

        高通量测序法

        准确性高

        价格高

        少数样本超多位点

        质谱法

        准确性高

        价格低

        大样本,多位点

        SnapShot

        准确性高

        价格低

        多位点,样本数不受限制(几十到几千)

         

        检测原理

        第一步:设计2SNP PCR引物,各对应于一个SNP的等位基因,如下图:

        Allele 1引物3'末端是Callele 2引物3'末端是A标签序列;Allele 1引物5'末端是F序列;allel 2引物5'末端是H标签序列。

         

         

        第二步:第一轮PCR,模板会与可互补的(3'末端能配对的)PCR引物进行退火,并发生扩增,这步完成SNP识别。

         

        第三步:第2PCR扩增,扩增出带有标签序列的PCR产物,这步完成把通用标签序列引入与SNP对应的PCR产物。

         

         

        第四步:经过接下来几轮的PCR扩增,一方面淬灭探针被切碎,另一方面荧光探针更多地退火到新合成的、没有淬灭基团的互补链上,发出荧光。

         

         

         

        送样要求

         

         

        要求

        样品

        血液样品(抗凝血≥500μl

        基因组DNA,需-20℃保存和运输

        DNA纯度

        OD260/280=1.6~1.8OD260/230=1.8~2.2

        DNA浓度

        30ng/μl

        单个PCR反应量(M

        PCR和测序结合法为100ngTaqman法为10ng

        DNA用量(ul

        PCR反应个数(N*M/C

                                                                        客户需提供准确的基因名称和序列以及详细的SNP位点信息。

         

        分子生物学服务

         

        业务咨询电话:138-1183-4242 汪先生

        客户服务电话:010-67883332-886

        分子生物学服务邮箱:market@sinogenomax.com

         

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