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        • 产品名称: >Small RNA测序
        • 上架时间: 2014-10-08
        • 浏览次数: 695

         

        技术简介:

        Small RNA是一类重要的体内调节分子,主要包括miRNApiRNAsiRNA。它的功能主要是诱导基因沉默,参与基因转录后调控,从而调节细胞生长、分化,以及个体发育、生殖等重要生物学过程。用高通量测序技术,一次性获得单碱基分辨率的数百万条Small RNA序列信息,依托强大的生物信息分析平台,鉴定已知小RNA,并预测新的小RNA及其靶标基因。 

         

        技术优势:

        不依赖已知信息:可对任意物种、任意大小、已知或未知的小RNA进行序列测定,可以鉴定已知miRNA,也可预测新的miRNA

        分辨率高:可检测单个碱基差异,区分相同家族或序列相似性极高的小RNA

        通量高:可精确检测出几个到数十万个拷贝的小RNA

         

         

        项目流程

         

         

         

        生物信息分析

                 

         

         

        1.miRNA数据库(miRBase)进行比对

        2.鉴定与重复序列相关的RNA

        3.对小RNA 序列进行注释分类

        4.差异表达分析和miRNA表达谱构建

        5.RNA 序列聚类分析

        6.通过生物信息学方法预测新的候选miRNAs

        7.将小RNA 定位到基因组上探索其在染色体上的分布特征

        8.病毒的鉴定及分析

        9.根据客户要求进行个性化跟踪分析

         

         测序策略及数据量 

         

         

        测序策略

        数据量

        Small RNA测序

        SR36

        10M或15M clean reads

         

        送样要求

        样本类型:完整且无污染的总RNA

        样本需求量:≥10 μg

        样本浓度:≥200 ng/μL

        样本纯度:OD260/280 =1.8~2.2OD260/2302.0

        28S:18S1.5RIN8.0

        23S:16S1.5 (此项要求只针对原核生物)。

         

         

        案例分析

                                       

                                                两个样品间的microRNA差异表达分析

         

                               

                                            MicroRNA聚类分析

                               备注: 红色表示上调,绿色表示下调,灰色表示在某个样品中未表达的microRNA

         

         

         

         

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