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        • 产品名称: 基于Miseq的微生物多样性分析
        • 时间: 2015-02-05
        • 浏览次数: 383

         

        基于Miseq的微生物多样性分析

         

        技术简介:微生物多样性检测,是以样品中的微生物群落作为整体进行研究,通过对核糖体RNA高变区域(比如16S/18S/ITS等序列)或功能基因(如古菌的氨氧化基因等)进行PCR扩增和测序,然后分析相应环境下微生物群落的多样性和分布规律。

         

        诺赛基因使用升级后的PE300 Miseq测序平台(读长可达2x300 bp),对环境、动植物等样本中微生物16S/18S/ITS区或功能基因进行扩增,结合公用数据库Nt,Sliva,Greengene(可选)注释,帮助科研工作者揭示环境样品中众多不同类型微生物种类以及它们之间的相对丰度和进化关系,从而探讨微生物多样性,对于研究微生物与环境的关系、环境治理和微生物资源利用有着重要的理论和现实意义。

         

        16S rDNA测序: 16S rDNA为编码原核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列,采用MiSeq测序仪,对16S rDNA某 个高变区进行测序,进一步做环境微生物中细菌或古菌多样性分析。

         

        18S rDNA测序: 18S rDNA为编码真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。在结构上分为保守区和高变区,保守 区反映生物物种间的亲缘关系,高变区反映物种间的差异。

         

        ITS 测序: ITS分为两个区域:ITS1/ITS2,ITS1位于真核生物核糖体rDNA序列18S和5.8S之间,ITS2位于真核生 物核糖体rDNA序列5.8S和28S之间。对ITS1或者ITS2进行测序,进一步做环境微生物中真菌多样性分析。

         

        目标区域扩增子测序: 根据客户的研究需求,利用第二代高通量测序技术,依据PCR产物长度大小,采用HiSeq或MiSeq测序仪,对某些目标基因的PCR产物提供测序及分析服务。

         

         

        服务流程

                     

         

        生物信息学分析                                  

         

         

         

        送样要求:

         

         

        诺赛优势:

        Ø平台先进:使用升级后的PE300 Miseq测序平台(读长可达2x300 bp),有着高性价比的测序优势,是微生物多样性检测应用的主流测序平台。

        Ø经验丰富:十五年微生物基因组研究经验。

        Ø准确性高:从碱基保守水平测定,真实反映物种情况。

        Ø鉴定高效:相比于传统鉴定方法,基于Miseq测序平台的测序鉴定微生物更快速和准确。

        Ø过程简单:环境样品(微生物群落)的最优解决方案,完全摆脱繁杂的菌株分离工作。

        Ø灵敏度高:可以鉴定到低丰度微生物。

        Ø成本低:需测序数据量少,检测成本低。

        Ø个性化服务:根据合作伙伴的需求,免费设计个性化的实验方案;可根据研究目的定制个性化生物信息分析服务。

         

        结果案例展示

         

        常见问题解答

         

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