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         2015年6月12日下午在北京河南大厦会议室,围绕生物样本标准化建设为切入点,加强ABO联盟单位需求对接的2015年ABO联盟第四期圆桌会圆满召开。

         

         会议由北京科信必成医药科技发展有限公司总经理王锦刚先生作为ABO联盟执委主持。

         

         第一个报告是由北京生物样本库资源中心王彭主任作的题为《北京生物银行的标准化建设与管理》。他介绍了北京生物银行的组织结构,是由北京市科委立项,由首都医科大学为主持单位,于2009年5月“北京重大疾病临床数据和样本资源库建设”项目正式启动,于2012年完成I期建设目标,投入6000万,取得了较丰硕的成果。2013年进入II期建设(预计投入4000万),目前已有脑血管疾病、慢性肾病、乙肝、糖尿病、心血管疾病、艾滋病、宫颈癌、乳腺癌和胃癌、骨科疾病、突发性疾病、结核病、精神疾病、脑脊髓血管病、消化系统肿瘤和儿童白血病共15个库进入II期建设,涵盖了中国十大重症疾病。王彭主任详细介绍了各库进入II期的准入标准,指出不太强调样本量,但是要求多中心来源的标本至少达到30%。II期建设的目标是建立统一的、符合国际规范的管理文件,完善二级管理制度和体系,强化第三方监管机制,制定纲领、管理、操作和证实性的四级文件。

         

         第二位报告人是北京大学生物动态光学成像中心白凡研究员。他介绍了单细胞测序技术在癌症血液检测中的应用。这方面的技术主要涉及三个环节,第一是把单个循环肿瘤细胞分离出来,主要的方法有,如强生公司的Cell Search仪器,比较准确,三道染色可达到100%,还有显微捕获以及微流控物理分选等,此外还有通过复性染色的选择方法。接下来是单细胞基因组扩增技术(MALBAC)以及测序,最后是对测序数据的分析和挖掘。白凡老师介绍说他们通过比较癌症原发灶组织、转移灶组织以及收集到的循环肿瘤细胞,发现三者中共有的肿瘤基因往往是癌症驱动基因,说明能够转移的肿瘤细胞是在生存上有着能够对抗生存选择压力的共同优势。目前白老师课题组已经将单细胞测序技术的应用从肺癌扩展到其他类型癌症,通过比较CNV等特征,可以对癌症进行分子分型以及预后的判断。白老师总结性地预测了该技术将在癌症复发预警、治疗效果预测、日常体检、靶向治疗药物选择以及微创诊断方面有很大的应用前景。

         

         来自天坛医院神经外科的保肇室研究员介绍了中国脑胶质瘤基因图谱计划(CGGA)数据库的标准化建设与应用。保老师介绍了天坛神经外科与诺赛基因、中国CDC等单位经过多年合作,对300多份脑胶质瘤进行了全部或部分样本的甲基化、mRNA、miRNA、lncRNA的芯片检测以及转录组、lncRNA、外显子组和全基因组的测序。目前已完成基因检测的数据量达30T。通过生信分析以及大量临床样本的验证,确定了IDH突变、MGMT启动子甲基化、miR-181d等基因分型和表达水平作为脑胶质瘤分子分型的标准。此外通过分析,他们还发现了PTPRZ1-MET融合基因在复发肿瘤中的比例高达15%,目前已启动了针对这个靶点的药物的临床研究。

         

         最后一位报告者是中国医学科学院肿瘤医院胸外科实验室的高亦博研究员。他报告的题目是《基于生物样本的转化医学研究设计》。高老师介绍了他所在实验室的基本情况、遗传资源样本来源和类型、在研项目及涉及领域。对于生物样本库的建设思路,高老师提出应该在患者队列、实验模型和生物分子水平的检测相结合。高老师还介绍了他在做科研中的一些心得,比如通过评估某期刊已发表文章在是否西方人关心的病种、前瞻性vs回顾性、作者单位、预后因素、多中心、建模和验证的队列规模等指标的分数,来判断自己所写文章被接收的机会大小,又比如TERT启动子甲基化检测,对于前期有很多的样本积累,或者可以在短时间里联合多中心的样本资源,都能敏锐感知、快速反应,复制类似的成功。高老师还以临床医生的角度,向我们企业提出几点忠告,即要克服大企业病,而应全身心投入到临床医学研究中;要把控住趋利冲动,临床资源是很宝贵的,应确保自己的产品相对成熟后再用临床样本来试验;在考虑成本的时候,要想得更长远一些,能够主动更多地承担一些责任。

         

         

        附 :北京生物银行的网址:www.beijingbiobank.com

         

         

        (撰稿   周玉娟)

         

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